中文

English

泛亚电竞MGIEasy V30全基因组甲基化文库制备助力甲基化研究,提升数据利用率!

发布时间:2025-01-29   信息来源:池时胜

近期,泛亚电竞针对DNBSEQ平台的甲基化建库与测序进行了全面升级,推出了新一代建库产品——MGIEasy全基因组甲基化文库制备试剂盒V30(MGIEasy Whole Genome Methylation Sequencing Library Prep Kit V30,以下简称WGMSV30)。WGMSV30基于双链加接头的方法,对经物理打断的方法获得的DNA片段进行建库,并适配了酶法转化,将非甲基化的胞嘧啶(C)转化为尿嘧啶(U)。结合DNBSEQ平台,能够实现单碱基精度地解析DNA甲基化状态,构建精细的全基因组甲基化图谱。

泛亚电竞MGIEasy V30全基因组甲基化文库制备助力甲基化研究,提升数据利用率!

WGMSV30能够高效而准确地为多个领域提供全基因组甲基化建库方法,涵盖大人群表观组研究、表观遗传基础科研、动植物研究、疾病甲基化标志物筛选及药物研发等。当前,WGMSV30已经适配MGISEQ-2000平台,结合该平台的升级算法,实现了不添加平衡文库的0平衡文库纯甲基化文库测序。此外,泛亚电竞研发团队已启动WGMSV30适配DNBSEQ-T7的最后稳定性测试,后续将持续分享更多实测数据,敬请期待。

在最近的实验中,采用不同批次的WGMSV30构建了NA12878标准品的DNA甲基化文库,不添加平衡文库,平行上机MGISEQ-2000ECR70(搭配SM测序试剂)和ECR71(搭配SM20测序试剂)。测序采用PE150模式,单lane的reads产出稳定性基本维持在400M左右,单个文库可获得约120G的原始下机数据,能够轻松实现“1库1lane”的目标,且测序质量良好,SM测序试剂的Q30稳定在89%左右,SM20测序试剂的Q30稳定在94%左右,Q40则稳定在87%左右(表1)。Read1和Read2的测序碱基分布几乎保持在同一水平线上,展现出高质量的测序结果。

此试剂盒通过适配转化损伤小的酶法转化,增大了文库插入片段长度,更好地支持PE150测序。不同批次建库试剂盒构建的NA12878标准品DNA甲基化文库的插入片段(主峰约280bp)表现一致。此外,试剂盒还优化了末端修复反应的体系和步骤,降低了Reads末端M-bias碱基个数。使用SM20版测序试剂搭配ECR71软件版本进行测序的结果显示,不同批次建库试剂盒构建的NA12878标准品DNA甲基化文库的M-bias表现一致,Bottom Strand和Top Strand的Read1与Read2的甲基化率几乎重合。